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Um Estudo Empírico de Alinhamento de Seqüências Utilizando Computação Sistólica e MPI

Deive Ciro de Oliveira

O presente arquivo descreve a implementação de um algoritmo paralelo para cálculo de Alinhamentos Ótimos entre duas seqüências de caracteres. Estratégias de solução para este problema são vastamente utilizadas na Biologia Computacional, especificamente na área de verificação de homologias. A abordagem utilizada tem como fundamento Teórico a Computação Sistólica, sendo implementada em um ambiente de Troca de Mensagens (MPI: Message Passing Interface).

http://www.lbd.dcc.ufmg.br:8080/colecoes/wob/2002/015.pdf

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