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Utilização do software MyGrid para adaptar uma aplicação de dinâmica molecular em uma Grade Computacional.

Patrícia M. de BarrosCleverson VeronezCarla OsthoffWalfredo CimeElizeu Santos-NetoLauro CostaPedro PascuttiAlan SilvaFabrício Silva

Podemos definir os projetos de Computação em Grade, como sendo projetos que têm como objetivo, combinar múltiplas máquinas geograficamente dispersas como plataformas para a execução de computação distribuída. O software MyGrid é um projeto de Computação em Grade que provê um ambiente de execução global para permitir a execução remota de uma grande quantidade de tarefas em paralelo através das máquinas que o usuário tem acesso. Este projeto foi criado e está sendo desenvolvido pelo Departamento de Sistemas e Computação da Universidade Federal de Campina Grande. Dentre as aplicações que necessitam de grandes recursos computacionais, temos as aplicações na área de dinâmica molecular. Utilizamos para os nossos testes na Grade, o software THOR - que é um pacote de programas para modelagem e dinâmica molecular criado em Fortmn 77. THOR está sendo desenvolvido e mantido pelo Laboratório de Física Biológica do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) da Universidade Federal do Rio de Janeiro, Brasil. O LNCC em colaboração com a UFCG, a Unisantos e o IBCCF estão com o objetivo de desenvolver um ambiente de execução de processos de dinâmica molecular em Grade. Este trabalho apresenta os testes preliminares implementados por este grupo em um sistema de Grade no Brasil para o estudo desta aplicação.

http://www.lbd.dcc.ufmg.br/colecoes/erad-rs/2003/0014.pdf

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