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Utilizacao de Infra-Estruturas de Grade para Computacao de Algoritmos de Bioinformatica

Débora Pandolfi AlvesLuciano P GasparyNey Lemke

O desenvolvimento da Bioinform´atica trouxe um novo desafio `a area de computac¸ ~ao: a execuc¸ ~ao de algoritmos que requerem alto poder computacional para lidar comuma grande quantidade de dados. Embora existam equipamentos capazes de desempenharesse papel, o alto custo dos mesmos restringe seu acesso, dificultando o desenvolvimentoda pesquisa na ´area. Este problema pode ser minimizado com a utilizac¸ ~ao de tecnologiasalternativas como a computac¸ ~ao em grade, que permite tirar proveito da infra-estrutura j´aexistente nas instituic¸ ~oes e que em grande parte do tempo se encontra subutilizada ou ociosa.Neste trabalho descrevemos o esforc¸o realizado no desenvolvimento de algoritmosde Bioinform´atica para execuc¸ ~ao em infra-estruturas de grades computacionais.

http://www.lbd.dcc.ufmg.br/colecoes/erad-rs/2006/0035.pdf

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