Robson M. Silva, Mariane R. Rita, Flávio F. Nobre.
Propomos um modelo computacional (AG/SVM) baseado na utilização do algoritmo genético (AG) e no classificador de máquina de vetor de suporte (SVM), a fim de identificar novas mutações de resistência para o Nelfinavir (NFV) e Lopinavir/Ritonavir(LPV/r). O modelo foi capaz de selecionar as posições I72 para o subtipo B e a mutação T74 específica do subtipo C, simultaneamente para NFV e LPV/r. A sensibilidade obtida com a incorporação das posições mais frequentemente selecionadas pelo AG no classificador SVM, foi superior a 99,49% para o subtipo B e 96,70% para o subtipo C. Os resultados obtidos mostram-se promissores o uso do modelo na identificação de novas mutações em pacientes com falha terapêutica aos inibidores da protease NFV e LPV/r, bem como na predição da resistência do HIV-1.
http://www.lbd.dcc.ufmg.br/colecoes/wim/2012/0015.pdf
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